Née sous le nom de Apogee Software, LLC, la société a été fondée le 14 juillet 2008 par Terry Nagy, qui a obtenu la licence du nom et du logo originels de l’ancienne Apogee Software (fondée en 1987 par Scott Miller). En 2021, elle a officiellement adopté le nom « Apogee Entertainment » et a recruté Scott Miller pour piloter ses opérations d’édition.